京都大学（きょうとだいがく，Kyoto University ）是日本的一所国立大学。它的前身是 1869 年 5 日本京都大学月建立的第三高等学校。1897 年第三高等学校的法学部及工学部变成京都帝国大学，第三高等学校改设大学预科。同年理工科大学、 1899 年法科大学以及医科大学、 1906 年文科大学建立。( 当时帝国大学不设学院而是下设分科大学 ) 大约 20 年后这些分科大学改称学部 ( 学院之意 )。在第二次世界大战后的学制改革中，第三高等学校剩余的部分 ( 大学预科 ) 并入京都大学。本部所在地围左京区吉田本町。京都大学现共有 10 个学部，各学部所属系科及附属设施有文学部，含文学、史学、哲学及人际学 4 系，共 51 个讲座，并设有文学博物馆、中亚研究所等；教育学部，含教育学、社会学、心理学 3 系共 14 个讲座。
京都大学是继东京大学之后成立的日本第二所国立大学。1892 年，23 位国会议员在向国会提出的一个议案中提出，日本仅有一所东京国立大学，缺乏竞争，对办学和学生的培养都不利，建议在当时的西京 - 京都建一所大学，1897 年议案被通过，大学得以诞生，当时定名为京都帝国大学。
初建时整个大学只有一个理工科分科大学，共有 6 个专业 21 个讲座，学生不到 500 人，木下广次为首任校长。数年之后，又增设了法科、医科、文科等 3 所分科大学，这时全校已有 5 个分科大学。4 年后新的大学令颁布，分科大学改名为学部。法学部原有的法律学和经济学分家，同时上升为学部。经过数年的努力，农学部和一些研究机构相继成立，学校规模有了很大的发展，学生人数成倍增加，京都第三高中并入后，以此为基础成立了人文学部，后发展成为今天的教养学部。
战后，按照新的教育法，全部实行新制，削去帝国大学中的 “ 帝国 ” 二字，清除军国主义对京都大学的破坏和影响，包括实行男女共学，清理教师队伍，废除一些不合时宜的讲座，增设教育学部、药学部和一些研究所，研究生的教育得到了长足发展，对外开放门户。这样，京都大学就成了在日本仅次于东京大学的学科齐全、规模宏大的国立综合大学。
从机构的设置和科学研究的组织上可以充分看出京都大学的特色。有不少研究所和中心是全国独一无二的，先进的仪器设备和优良的研究环境为科学研究准备了得天独厚的条件，研究人员如鱼得水，因而无论在研究课题和研究成果上在日本均很有影响。
在基础理论研究方面，京都大学更是走在日本各大学的前面，影响最大的是以汤川秀树为首任所长发展至今的基础物理研究所，现已成为世界基础物理理论研究的中心之一，研究领域包罗了天体物理、基本粒子、原子核、宇宙、统计物理、物性等诸多方面。
在化学反应理论研究方面，福井谦一的量子化学边界轨道理论已应用于化学工程，1987 年获得了诺贝尔奖。数理分析研究沟通了自然科学和社会科学两大领域。借助数学模型的方法已愈来愈普及到对理论问题的研究，并实现计算机处理的程序化。病毒的研究、癌的发生和遗传理论也有所进展。
在人文科学的研究方面，京都大学同样十分重视具有自己的特色，在京大历史上也出现了不少世界著名的优秀学者，有的还得到日本文化勋章。如日本哲学宗师西田几多郎，法学的佐佐木恣。研究中国史的贝冢茂树，研究中国文学的吉川幸次郎等。
京都大学与东京大学虽为日本东西两方齐名的国立大学，但它们的传统与办学目标迥然不同。东京大学以培养治国人才为主；京都大学则以培养科学家见长。在科学研究方面，人才和成果都不少，因而被人们称为 “ 科学家的摇篮 ”。
特别引以自豪的是，在 1949 ～ 1987 年的 38 年中，日本获诺贝尔奖的 7 名得主中京都大学就占 4 名（又有人说是四个半）。获日本文化勋章和日本科学院奖以及其他方面奖励的更是数不胜数，这些成就的取得同它的优秀传统是分不开的。
京都大学一向注重于学术上的高标准，从创校以来就有理重于文的传统，在全校的学部、研究所、教学与科研中心中理科明显占优势，因而形成了富有特色的 “ 京都学派 ”。
人们曾这样形容 “ 京都学派 ” ： “ 即使在常人看来芝麻一样的小事，京都大学教授也会饶有兴趣，只要合乎学术道理的，就会义无反顾地去做 ”。这个学派最早是京都大学文学部著名的哲学家西田几多郎以及他的弟子田边元、三木清等人倡导发起的，原意是指他们对日本哲学的研究有独到的见解，后来日本学术界引伸为京都大学毕业出来的 “ 不问实际，只管求知 ” 的一群人。正是他们这种 “ 兴趣 ” 和 “ 执着 ” 才使京都大学成了科学家的摇篮。
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