农业类专业
北海道大学北海道大学的前身是札幌农学院，农学部拥有日本最好的农业教育。农学院专业设置：共生基础学、生物资源科学、应用生物科学、环境资源学。
东京大学 农学生命科学研究科专业设置：生产·环境生物学、应用生命化学、应用生命工学、森林科学、水圈生物科学、农业·资源经济学、生物·环境工学、生物材料科学、农学国际、生圈系统、应用动物科学、兽医学。
名古屋大学生命农学研究科专业设置：生物圈资源学、生物机构·机能学、应用分子生命科学、生命技术科学。
经济、金融类专业
一桥大学 前身为1875年由森有礼及福泽谕吉创设之商法讲习所，1920年改为旧制东京商科大学，是日本旧三商大之一，成立以来培养了大批金融界精英。经济学研究科专业设置：经济理论·经济统计、应用经济、经济史·地域经济、比较经济·地域开发。商学研究科专业设置：研究者培养、经营学硕士、执行官教育。
神户大学神户大学起初是以培养商业、经济人才为目的的商科大学，因此以经营学最负盛名，是日本现代经营学研究的发祥地，得到日本社会各界的高度评价，尤其在经济界的毕业生极多，常有“东一桥，西神大”的说法。经济学研究科专业设置：理论、历史、计量、政策、技术·环境、金融·财政、国际经济、比较经济、经济学。经营学研究科：经营学、会计学、商学。
大阪市立大学
教育类专业
广岛大学 广大由战前老牌名校广岛文理科大学和广岛高等师范学校为首的多所学校合并而成，其教育学实力超强，被公认为该校的名牌专业之一。其入学门槛极高，很多申请该研究生的学生日语成绩都达到150分以上。教育学研究科专业设置：学习开发学、教科教育学、日本语教育学、教育学、心理学、高等教育学。
北海道大学教育学院专业设置：学校教育论讲座、教育心理学讲座、身体教育论讲座、生涯学习论讲座、临床心理学讲座、多元文化教育论讲座、教育社会论讲座、健康教育论讲座。、
京都大学教育学研究科专业设置：教育科学、临床教育学。
医学专业
东北大学 东北大学医学研究科历史上有多位日本文化勋章获得者及日本学士院奖获得者，在医学研究方面一直走在日本医学界前列。医工学研究科专业设置：医工学。
大阪大学 大阪大学医学研究科的优秀程度某种程度上已经超过了著名的东京医科齿科大学。2012年诺贝尔奖获得者山中伸弥就是在大阪大学取得的博士学位。医学系研究科专业设置：医学专攻、医科学专攻、保健学专攻。齿学研究科专业设置：口腔科学专攻。
名古屋大学 前身是1871设置的临时医院与临时医学校，至今拥有140余年的历史，且不断发展壮大。医学部与医学系研究科与美国哈佛大学等8所欧美顶级大学签订了交换留学项目，实力超群。医学研究科专业设置：医科学、医科学医疗行政、看护学、医疗技术学、康复医疗学。
金泽大学在这所综合性非常强的大学中，其医药学独树一帜，在日本医疗界享有很高的地位，有“名门”之称，在金大医学部及其癌症研究所在世界抗癌研究领域首屈一指。医药保健综合研究科专业设置：医科学、创药科学·药学、保健学。先进预防医学研究科专业设置：先进预防医学共同专攻、情报医工学、omics（组学）解析。
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