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英国爱丁堡大学研究生BILG1004下一代基因组学课程预习

来源: 留求艺 更新时间:2024-04-17 00:00

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BILG1004是爱丁堡大学生命科学学院开设的一门专业课程,适合研究生阶段的同学学习,中文全称【下一代基因组学】。这门课程有5个学分,2023年的课程从爱丁堡大学的第二学期开始开放。趁课程还没开始,小伙伴们赶紧跟随小编一起预习一下课程将要学习的重点内容吧!

英国爱丁堡大学研究生BILG1004下一代基因组学课程预习

一、BILG1004

下一代基因组学课程将介绍和探索下一代基因组学分析所需的新算法和应用。第二代和第三代测序技术的爆炸导致了分析产生的大量原始数据的生物信息学方法的相应革命,以及挖掘这些数据以获得生物学洞察力的新挑战。

本课程将介绍下一代基因组学技术,并指导学生通过广泛应用的数据的生物信息学分析。课程特别关注建立对生物信息学分析中使用的算法的理解,以及遗传可变性、基因组复杂性和实验及统计噪音之间的相互作用。还强调需要适当的生物信息学工具来分析复杂的基因组,并使用一系列的实践课程来展示这些方法在研究非模型系统中的效用。

二、课程重点

本课程将通过结合授课、课堂讨论和动手实践的方式进行,主要涵盖以下主题领域:

1.介绍下一代测序技术的多样性,包括最近在长阅读测序方面的创新。

2.下一代测序数据的结构,包括不同测序技术的技术规范和序列文件格式。

3.从头基因组组装的生物信息学方法,以及非模式动物和植物基因组的特征。

4.从与参考基因组比对的序列数据中鉴定遗传变异体。

三、课程核心技能要求

1.展示对下一代测序技术的分子和技术基础的理解,并批判性地评估这些技术对特定生物研究问题的实用性。

2.熟悉数据分析中使用的核心算法,能够以明智的方式为特定问题选择最佳的分析解决方案。

3.理解基因组组装算法如何完成它们的任务。

4.使用流行的质量控制方法,如FastQC和新兴的基因组组装软件,如Wtdbg2/Redbean,可用于分析基因组测序数据。

5.理解个体和群体的序列数据如何能够阐明潜在的生物学过程。

以上就是关于英国爱丁堡大学【下一代基因组学】这门课程的主要内容介绍,同学们可以参考预习。学习中有任何问题,欢迎咨询留求艺的专业老师!

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