日内瓦拥有多所大学，其中最著名的包括：
日内瓦大学（Université de Genève, UNIGE）
创办时间：1559年
学科：自然科学、医学、文科、社会科学、经济学、法学、心理学、教育科学、神学、翻译学院等
学生人数：约13,379人
国际学生比例：约37.2%
特点：是瑞士最古老的大学之一，也是欧洲研究型大学联盟（LERU）的成员。
苏黎世联邦理工大学（Eidgenössische Technische Hochschule Zürich, ETH Zurich）
地理位置：苏黎世州
特点：位于瑞士最大的城市苏黎世，是瑞士最重要的理工类高等学府之一。
瑞士联邦理工学院（École Polytechnique Fédérale de Lausanne, EPFL）
地理位置：洛桑
特点：位于瑞士法语区以外，是瑞士另一所顶尖的理工类高等学府。
此外，日内瓦还有其他一些高等教育机构，如日内瓦国际学校、国际关系研究院等。
