日本生物学的研究方向非常广泛，主要包括以下几个领域：
研究细胞学、分子生物学、遗传学、表观遗传学、神经生物学等。
涵盖动物生理学、解剖学、胚胎学、神经生物学、发育生物学、昆虫学、动物行为学、组织学等。
包括古生物学、进化论、演化生物学、社会生物学、分类学、系统分类学、生态学、生物分布学等。
研究生物技术、基因工程、酵素工程学、生物工程、代谢工程学、基因体学、合成生物学等。
研究大气生物学、生物地理学、海洋生物学、淡水生物学、地球生物学等。
包括应用植物学如农学（或农艺学）、园艺学、花卉学、植物育种学、林学、植物病理学等。
研究生物体对抗原物质的免疫应答及其方法。
培养能够从事现代药物开发和生产的基本理论、方法以及现代化学与生物制药的工程技术。
研究病原体和宿主细胞相互作用的一门交叉学科。
如生物化学、食品工学、微生物学、营养化学、分子细胞生物、应用微生物等。
日本的一些著名大学，如东京大学、京都大学、东京工业大学等，在生物学领域都有卓越的研究和教育水平。这些大学提供的研究课程和方向反映了生物学研究的多样性和深度。
