超期就是非法滞留了。
抓紧时间去日本警察局报到吧，如果超期时间不长，主动申报的话，他们会给你盖个章，然后你买机票回国就可以了。但是因为你滞留，会留下不良记录，给你发【身元保证书】的单位也会受影响的： 如果是商务签证或探亲签证等的话，就相当于把你的商务客户、亲戚朋友给害了。如果是个人旅游签证的话，就算是把送签社给害了。一、申请流程
1. 签证申请者确定赴日目的并拟定行程计划。
2. 登陆日本驻华使领馆官方网站，浏览有关签证申请信息和签证所需材料，下载签证申请表。
3. 选择代理机构办理签证申请，准备签证材料，缴纳签证费和签证服务费。
4. 等候签证申请审核或补充资料。
5. 领取签证。拿到签证后，应及时仔细核对签证上的各项信息是否正确，尤其是签证有效期的起止时间及停留天数是否与所申请的相符，签证上的个人信息如姓名拼写是否正确，如发现任何错误，应及时与使领馆联系。
二、签证材料
1. 团体与个人观光旅行签证
1) 签证是发给以观光旅游为目的申请人，除观光旅游以外的短期访问目的都不属于此类签证颁发范围。
2) 团体观光旅行：人数在5名—49人以下为团体，赴日行程15天以内。
3) 个人观光旅行：日方对人数更少的中国游客可发放个人旅游签证。与团队观光不同的是中日双方旅行社均不需要派领队和导游。
4) 中国公民如需申请此类签证，需通过日本驻华大使馆或总领事馆授权的中国各旅行社进行申请。有关签证手续，由各指定旅行社代为申请。
2. 短期商务签证
1) 签证申请表（网上下载，也可在窗口领取）.
2) 白底照片（长4.5cm、宽3.5～4.5cm）1张.
3) 护照.
4) 暂住证或居住证明（仅限户口不属于相关使领馆领区内的申请）.
5) 职业证明（只限于持因私护照的申请者）.
6) 所属单位的营业执照或经营许可证复印件（只限于持因私护照的申请者）.
7) 户口簿复印件.
8) 日方邀请单位应提交的材料详见使馆网站说明。
3. 配偶短期停留签证
1) 颁发对象：
（1） 在中国国内居住1年以上日本人（不包括无签证者和持有有效期低于6个月的人员）的中国配偶。
（2） 若有去过日本的经历，且在日本停留期间，未违反出入境管理及难民认定法等日本国的法律。
（3） 不符合以上条件且不能提供以下材料者，应按一般探亲访友形式申请签证。申请多次签证时，必须能确认夫妻结婚及在中国同居一年以上，且申请人有一次以上的赴日经历。
2) 所需材料
（1） 签证申请表（网上下载，也可在窗口领取）。
（2） 白底照片（长4.5cm、宽3.5～4.5cm）1张。
（3） 护照。
（4） 户口本首页及申请人本人页复印件。
（5） 暂住证或居住证明（仅限户口不属于相关使领馆领区内的申请）。
（6） 多次签证申请理由书（仅限申请多次签证时提交）。
（7） 申请人配偶（日本人）还需提护照复印件（包括首页、签证页、居留许可页、出入境记录页）和户籍誊本（发行后3个月内、能确认户主为该日本人，且与申请人有婚姻事实）。
（8） 申请人或配偶另外还需提供家庭收入主要来源者的在职证明等能证明在职的材料，以及家庭收入主要来源者能证明收入所得的材料。
4. 探亲访友签证
1) 签证申请表（网上下载，也可在窗口领取）。
2) 白底照片（长4.5cm、宽3.5～4.5cm）1张。
3) 护照。
4) 户口本首页及申请人本人页复印件。
5) 暂住证或居住证明（仅限户口不属于相关使领馆领区内的申请）。
6) 能证明与在日亲属或朋友关系的材料(如亲属关系公证书、照片、书信等)。
7) 日方担保资料和邀请人需准备材料详见使馆网站。
5. 访日医疗居留签证
1) 医疗居留签证是发给以在日本接受治疗为目的而访日的外国患者(包括短期住院接受全面检查的受诊者等)及其陪护人的签证。
2) 接纳范围：不仅限于在医疗机构中的治疗行为，还包括短期住院接受全面检查、健康检查、牙科治疗、疗养等。
3) 根据需要，发给外国患者多次有效的签证。多次有效签证仅限于发给1次停留期在90天以内的人。申请多次有效签证时，需要提交医生出具的“治疗预定表”。
4) 陪护人可以是患者的亲属，也可以是非亲属。陪护人将与患者获得相同的签证。但是，陪护人的访日目的仅为照料该患者的日常生活，不得从事可以获得报酬的活动。
5) 有效期限为3年或根据患者的病情等而定。
6) 停留期，最长6个月。具体停留期依患者病情而定。预定停留期超过90天的，必须以住院为前提。这种情况时，外国患者必须通过本人住院的医疗机构之职员或居住在日本的本人亲属，从法务省入国管理局取得在留资格认定证明书。
7) 签证申请手续注意事项
（1） 希望在日医疗机构接受治疗的外国患者需参考使馆网站所列的身份担保机构（国际医疗交流协调员、旅行社等）一览表，并与其中任何一个机构联系，委托受诊等安排。
（2） 请通过身份担保机构确定接纳医疗机构，并取得“医疗机构发行的受诊预定证明书及身份担保机构发行的身份保证书”（根据需要，也请取得治疗预定表）。
（3） 外国患者在日本驻外使领馆申请签证时，需提交以下材料。（陪护人请提交以下1～3及6。）
8) 护照。
9) 签证申请表。
10) 照片。
11) “医疗机构发行的受诊等预定证明书及身份担保机构发行的身份保证书”。
12) 证明具有一定经济能力的材料（银行余额证明书等）。另，根据外国患者的国籍，提交材料会有所差异。具体提交材料，可咨询居住地所属领区的大使馆或总领事馆。
13) 户口簿复印件。
（1） 暂住证（只限于户口不在本领区内的申请）。
（2） 在留资格认定证明书（因住院接受治疗，必需居留90天以上时）。
（3） “治疗预定表”（因需多次治疗必需访日时）。
应该先到公安局挂失，办理新的护照。但是你原本的护照上面有签证的信息这个很难办，总之先打电话给日本驻华大使馆，如果有复印件的话最好了，提供你的签证信息证明你的在留时间尚未到期。回来日本后申请新的外国人登陆证还有其他证件就好了。〖需要提交的材料〗
※ 登录证明书发行申请书(申请窗口有提供)※ 护照※ 照片2张(4.5cm×3.5cm、6个月以内照的免冠、正面上半身的照片)，未满16岁的不要提交照片。
※ 遗失登录证的书面报告，或者公安部门出示的"遗失登记"或"失窃登记"书面报告。注 意如果知道登录号码，再补办的手续就比较容易。如果丢失者年龄在16岁或以上，就要在指定的时间内再到以上地点领取新证，从提出申请日起通常需要约2周时间。
日本签证申请，按大使馆要求提供相应申请材料就可以。如果大使馆不需要你提供无犯罪证明，那就不用提供。也不会查这个的。不用担心
第一次是什么签证二返又是什么签证、期间在国内呆了多久，如果只是最高学历不一样的话时间吻合就没问题，别的地方就得另说了。
留学签证可以转成工作签证。
你的事情有点悬。想办工作签证不那么简单，不管是真就职，还是假就职，你都要先找个会社，然后由会社出具会社的具体材料，如会社的营业执照、公司规模、纳税情况、雇佣合同、雇佣理由书等等。至于你个人的材料，只需出具中国国内的最终学历证书、日本的学历证书、护照等。
若无门路，找行政书士，若成功得到签证，可能要花十几或几十万日元，不成功，也花几万日元。至于说要花多长时间，那就要看签证审查官对你和雇佣你的会社的诚信度、背景要花多长时间来调查了，会社的信用度不好或规模不大，拒签的可能性就高，雇佣理由不充分，也会被拒签，当然如果你的最高学历不高的话，也会被拒签，另外，同等条件，审查官的不同，结果也会不同，换句话说，即使不利的条件，在不同的审查官之下，也可能会不同的结果，有人会得到签证，也有人会被拒签，一切都要看运气。
如果在你申请工作签证时，留学签证到期，那你可以先到入管局一种临时签证，期限是3个月到半年不等，可以延长一次，具体请到入管局或专业行政书士咨询，理由是你现在正在进行就职活动。
你的留学签证到期，不会对你现在所使用的手机、银行账户有任何影响，但是对你打工的就有很大的影响了，如果你不能及时的更新签证，就可能打不了工，当然，打黑工就另当别论了。
希望你能一直以合法身份待在日本，祝你好运。
不是专业人士，个人经验，仅供参考。
