办理港澳通行证工本费用100元，如果需要在办理地拍摄港澳通行证所需的照片需要另外支付拍照费用20-30元；如果需要后续通过快递寄送港澳通行证的话，需要另外支付快递费用10-20元；如果需要在办理一次往来签注，每个20元，二次往来签注，每个40元，并外加签注加注费20元。
(一)登记备案登录我局电子政务平台，进行企业备案注册登记，并在网上输入当年度需备案的人员名单;网上登记预审通过后，凭打印取得的预约信息表和派遣函在指定日期，携带以下材料，来我局办理登记备案。
1、提交《申请港澳商务登记备案预约信息表》。
2、提交附有《备案人员名单》且盖有单位公章的《往来港澳商务事由说明函》。
3、交验有效的营业执照(持旧版营业执照或有关登记证书的，还须交验有效的组织机构代码证和税务登记证)副本原件，并提交复印件。
4、提交一个月内由人力资源和社会保障部门签发的《单位参加城镇社会保险基本情况》、《单位职工参加城镇基本养老保险情况》、《参保个人城镇基本养老保险缴费情况》(共三联)原件，并提交复印件。
(前两联应含备案人员所在企业名称、备案人员在本企业缴纳养老金的名单、签发日期等内容，第三联应显示该备案人员截至申请之日在本企业已连续正常缴纳社保6个月以上。)经营企业委托人才服务行业代管人力资源保障的，另须提交人才服务行业出具的代管人力资源保障的相关证明。
5、交验由本市税务部门出具的企业近12个月营业税或增值税纳税证明，并提交复印件。
(二)办理多次商务签注经备案后的人员可登录我局电子政务平台预约办理与备案资格相符的港澳商务签注，网上预约通过后，凭取得的预约信息表在预约有效期之前，携带以下材料，来我局办理港澳商务签注：
1、提交申请港澳商务签注预约信息表。
2、交验有效的《企业机构港澳商务签注登记备案证》原件，并提交复印件。
3、本市户籍的备案人员，如申请签注的同时需办理首次申请或换、补发港澳通行证的，则还须交验有效身份证原件;申请单独签注的，无须提交。
4、外省市户籍的备案人员，交验有效身份证、《居住证》原件，并提交《居住证》复印件;5、申请单独签注的，须提交有效的港澳通行证(本式港澳通行证的，需有效期三个月以上，空白页两页以上);如需同时办理首次申请或换、补发港澳通行证的，还须提交《中国公民出入境证件申请表》，并采集指纹信息以及在我局的社会服务照相点采集出入境证件电子照。
6、提交预约信息表上要求的其他材料。
(三)办理三个月一次商务签注在本市经营或者就业的个体工商户经营者、持《临时居住证》的外省市户籍人员以及未办理港澳商务签注登记备案的人员，如需办理三个月一次港澳商务签注，无需网上预约，可携带以下材料来我局办理：
1、提交《中国公民出入境证件申请表》。
2、提交盖有单位公章的《往来港澳商务事由说明函》。
3、交验有效的营业执照(持旧版营业执照或有关登记证书的，还须交验有效的组织机构代码证和税务登记证)副本原件，并提交复印件。
4、提交一个月内由人力资源和社会保障部门签发的《单位参加城镇社会保险基本情况》、《单位职工参加城镇基本养老保险情况》、《参保个人城镇基本养老保险缴费情况》(共三联)原件，并提交复印件。
(前两联应含备案人员所在企业名称、备案人员在本企业缴纳养老金的名单、签发日期等内容，第三联应显示该备案人员截至申请之日在本企业已连续正常缴纳社保3个月以上。)经营企业委托人才服务行业代管人力资源保障的，另须提交人才服务行业出具的代管人力资源保障的相关证明。
5、本市户籍人员，如申请签注的同时需办理首次申请或换、补发港澳通行证的，则还须交验有效身份证原件;申请单独签注的，无须提交。
6、外省市户籍人员，交验有效身份证、《临时居住证》或《居住证》原件，并提交《临时居住证》或《居住证》复印件;7、申请单独签注的，须提交有效的港澳通行证(本式港澳通行证的，需有效期三个月以上，空白页两页以上);如需同时办理首次申请或换、补发港澳通行证的，还须采集指纹信息以及在我局的社会服务照相点采集出入境证件电子照。
《往来港澳通行证》每本100元；一次往来签注，每个20元，二次往来签注，每个40元，并外加签注加注费20元。
港澳通行证一年两次和三个月的主要的区别就是有效期的长短。一年两次签注的话，是指在一年内可以赴香港或者澳门2次。每次逗留不超过7天，一年时间到期后就要重新申请签注；三个月一次是指有效期是三个月，在三个月内只能赶赴香港或者澳门一次，逗留时间不超过7天，过了三个月的期限，再去香港或澳门的话要重新申请签注。
签注分别以下这些:
L签注（即旅游签注，必须随团进出，种类分为3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次）；
S签注（即商务签注，种类分为3个月1 次、3个月多次、1年多次）；
T签注（即探亲签注，种类分为3个月1次、3个月多次）；
G签注（即个人访问签注，种类分为3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次）；
Q签注（即其他签注，种类分为3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次）；
D签注（即逗留签注，多次有效，出境有效期根据香港或澳门有关部门批准的期限签发）。
