１、可以办理的城市不同：
办理个人Ｇ签，只能是已经开通港澳自由行的城市居民方可办理，如果是没有开通自由行的城市的居民只能办理团队Ｌ签。２、过关方式不同：
签注为Ｇ签的，可以从自己所在城市直接过关飞往香港；Ｌ签的只能选择在深圳或珠海出关，不可以直飞香港。但都可以从香港直飞回大陆国内城市。
３、签注方式不同：
公民若跟随旅游团前往是必须办理团队签注，而个人前往就需要办理个人签注。
签证的过程不一样。
港澳通行证个人签就是自己准备相关材料、自己预约签证时间、自己亲自办理签证的过程；而团签则是提供相关材料，委托旅行社办理签证的过程。
港澳通行证团签是指旅行社组织的团队赴港澳旅游办理的签证，而个签是指个人探亲、商务、非跟团个人旅游、就学、就业、培训及特殊事由如治病、奔丧、诉讼等办理的签证。
团签与个签在过关方面，团签需要提前一天将你的姓名、性别、出生年月日、签发地、证件号码、出关时间、联系人电话报给旅行社后由旅行社报海关系统，第二天就可以正常过关了，而个人签证的话则不受限制，持证随时都可以过关。
